تتوزع مجالت عمل المؤسسة على العديد من الأنشطة والمجالت بحسب وصية الموقفة حفظها الله، ومن أهم هذه المجالت: المجال العلمي والتربوي، وينحصر في العلوم النافعة للمسلمين ،والمجال الدعوي،  والمجال الجتماعي والإغاثي،  وبناء المساجد وعمارتها،  والمجال الصحي ،والمجال الإعلمي،  ودعم الأوقاف وإقراضها في التأسيس والتطوير،  ودعم الجهات والجمعيات والمشروعات غير الربحية وتطويرها. وقد رأى مجلس النظار بناء على الصلحيات الموكلة له؛ أن تكون التقنية هي مجال التركيز لمصارف الوقف في خلل الفترة الحالية.